Projet de recherche en génomique visant à étudier les hotspots de recombinaison indépendants du gène Prdm9 chez les mammifères placentaires. Il permet d'analyser des données génomiques (séquençage, cartes de déséquilibre de liaison) pour comparer des espèces et identifier des motifs évolutifs. Les résultats sont utilisés pour comprendre les mécanismes de recombinaison et leur impact sur la diversité génétique.

Outil spécialisé dans l'imputation et l'analyse de données génétiques. Il permet de traiter des données brutes pour corriger les erreurs, imputer les valeurs manquantes et identifier les segments génomiques étrangers. Utilisé principalement dans le domaine de la génétique des populations et de la cartographie génétique, il facilite la détection de recombinaisons et l'estimation des fréquences alléliques.

Le package R 'sameStrain' est un outil dédié à l'analyse et à la simulation de données génétiques de bactéries. Il permet de calculer des statistiques sur les données, de simuler des événements de mutation et de recombinaison, et de visualiser les résultats grâce à des graphiques générés avec ggplot2.

Ce projet est une suite d'outils bioinformatiques dédiée à l'analyse de la sélection positive dans les gènes hautement recombinants. Il permet de modéliser les mutations génétiques, de calculer des matrices de mutation et de reproduire des figures scientifiques à partir de données génomiques. Les résultats aident à comprendre les mécanismes évolutifs et l'impact de la recombinaison sur la sélection naturelle.