REPET-snakemake est une suite logicielle dédiée à l'identification, l'annotation et la classification des éléments transposables (transposons, rétrotransposons) dans les génomes eucaryotes. Elle permet aux chercheurs en génomique de détecter et caractériser les séquences répétées, essentielles pour comprendre l'évolution des génomes et leur impact sur la fonction des gènes. Les pipelines automatisés génèrent des rapports détaillés et des visualisations pour faciliter l'analyse des données génomiques.

Outil bioinformatique conçu pour identifier et traduire les cadres de lecture ouverts (ORF) dans des séquences nucléotidiques. Il permet de maximiser la traduction des régions non-stop d'un génome tout en minimisant le chevauchement des ORF. Utilisable sur tout type de génomes (bactéries, virus, eucaryotes), il facilite les analyses comparatives de séquences génétiques via des comparaisons de codons ou d'acides aminés.