Projet dédié à la traduction et au regroupement de séquences nucléiques de la base de données RVDB. Il permet d'analyser et de structurer des données génomiques virales pour faciliter la recherche en virologie. Les outils développés automatisent des pipelines complexes pour traiter des versions successives de la base RVDB, en intégrant des métadonnées et des références taxonomiques.

Outil open source dédié à l'encodage numérique de séquences d'acides nucléiques et d'acides aminés. ISIDASeq permet de générer des k-mers de différentes longueurs, regroupés selon leurs propriétés physico-chimiques, avec diverses options de normalisation et l'inclusion de compléments inverses pour éviter le surcomptage. Il facilite l'analyse comparative et la modélisation de données biologiques complexes.

Package R pour l'estimation, la simulation et le calcul exact de fiabilité de modèles de Markov flottants, conçu pour modéliser la flexibilité des hétérogénéités de séquences dans des contextes tels que l'analyse de séquences d'acides nucléiques.