Panacus est un outil dédié à l'analyse statistique de fichiers GFA, principalement utilisés en génomique pour représenter des graphes de pangenomes. Il permet de calculer des histogrammes de couverture, des statistiques de croissance du pangénome et des tableaux de couverture résolus par groupe ou par chemin. Son utilisation est particulièrement adaptée aux graphes non chevauchants où les liens entre segments sont bien définis.

Outil spécialisé dans l'imputation et l'analyse de données génétiques. Il permet de traiter des données brutes pour corriger les erreurs, imputer les valeurs manquantes et identifier les segments génomiques étrangers. Utilisé principalement dans le domaine de la génétique des populations et de la cartographie génétique, il facilite la détection de recombinaisons et l'estimation des fréquences alléliques.

Outil d'aide à la création de hubs colorés à partir des résultats de chromHMM. Permet aux chercheurs en bioinformatique de visualiser et analyser les données de segmentation chromatinienne de manière automatisée et reproductible. Facilite l'interprétation des modèles de Markov cachés appliqués à la génomique.