Re-BERT est un projet d'extraction de relations entre entités dans du texte, utilisant différents types de modèles BERT. Il permet de détecter et d'extraire des relations spécifiques entre des entités nommées, telles que des personnes, des organisations ou des lieux, dans des données textuelles. Re-BERT est particulièrement utile pour l'analyse de données biomédicales, où il peut aider à identifier des relations entre des molécules, des gènes ou des maladies.

Bionlp-st-py est un parseur Python dédié au format BioNLP-ST, utilisé dans l'analyse de textes biomédicaux et l'extraction d'informations à partir de données biologiques. Il permet de générer des arborescences annotées à partir de fichiers texte, a1 et a2.

Bibliome Java Utilities est un ensemble d'outils Java dédiés au traitement de données biomédicales, à la gestion de jeux de données, à l'analyse de texte et à la gestion d'annotations. Il offre une large gamme de fonctionnalités pour faciliter le travail des chercheurs et des professionnels de la santé.