DeProj est un outil d'analyse d'images microscopiques conçu pour corriger les distorsions géométriques induites par la projection 2D de tissus épithéliaux ou cellulaires. Il permet de mesurer avec précision les propriétés morphologiques des cellules (aire, périmètre, orientation, etc.) en tenant compte de la topographie réelle du tissu, évitant ainsi les erreurs liées à une projection plane classique. Utilisé principalement en biologie cellulaire et en imagerie médicale, il s'intègre dans des workflows d'analyse d'images 3D pour fournir des métriques fiables et exploitables.

Ce projet propose des plugins Python pour la plateforme Gnomon, permettant de transformer des images 3D de tissus biologiques en représentations topologiques. Ces outils sont conçus pour faciliter l'analyse et la modélisation de structures complexes, notamment dans le domaine de la recherche médicale ou biologique. Le package s'intègre directement à l'écosystème Gnomon, offrant une solution spécialisée pour les scientifiques et chercheurs.

Zellige est un outil logiciel dédié à l'extraction automatisée de surfaces multiples et variées à partir d'images 3D acquises par microscopie de fluorescence. Il permet de segmenter et projeter plusieurs surfaces d'intérêt dans un même volume, même en présence de textures, contrastes ou inclinaisons variables. Conçu pour les biologistes et chercheurs, il facilite l'analyse quantitative des tissus épithéliaux en générant des projections 2D précises à partir de données 3D complexes.