Bibliothèque Python dédiée à l'analyse des trajectoires cellulaires issues de méristèmes apicaux caulinaires (SAM). Permet aux chercheurs en biologie végétale d'étudier la dynamique de croissance des cellules pour mieux comprendre les mécanismes de développement des plantes. Facilite l'extraction et la visualisation de données complexes à partir d'images de tissus végétaux.

MorphoNet est une plateforme web dédiée à la visualisation et à l'interaction avec des jeux de données morphodynamiques complexes. Elle permet aux chercheurs et aux enseignants d'explorer, d'analyser et de partager des données issues de la recherche en biologie, notamment dans des domaines comme la morphologie ou la dynamique des tissus. L'outil facilite la compréhension des phénomènes biologiques grâce à une interface intuitive et des fonctionnalités interactives.

Zellige est un outil logiciel dédié à l'extraction automatisée de surfaces multiples et variées à partir d'images 3D acquises par microscopie de fluorescence. Il permet de segmenter et projeter plusieurs surfaces d'intérêt dans un même volume, même en présence de textures, contrastes ou inclinaisons variables. Conçu pour les biologistes et chercheurs, il facilite l'analyse quantitative des tissus épithéliaux en générant des projections 2D précises à partir de données 3D complexes.

RCsparql est un projet dédié à l'analyse de réseaux réglementaires tissulaires, permettant l'identification de circuits réglementaires spécifiques aux tissus et l'étude des perturbations modulaires dans les maladies complexes. Il intègre des données issues de différentes sources et fournit une interface SPARQL pour interroger ces données.

Ce projet propose des plugins Python pour la plateforme Gnomon, permettant de transformer des images 3D de tissus biologiques en représentations topologiques. Ces outils sont conçus pour faciliter l'analyse et la modélisation de structures complexes, notamment dans le domaine de la recherche médicale ou biologique. Le package s'intègre directement à l'écosystème Gnomon, offrant une solution spécialisée pour les scientifiques et chercheurs.