Annuaire des initiatives

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  • Disseq est un projet dédié au calcul de distances entre séquences génétiques, notamment entre reads issus de séquençage NGS. Il permet de comparer des barcodes ADN ou des séquences génétiques pour des analyses environnementales ou taxonomiques. Les outils développés génèrent des matrices de distances exactes ou approchées, facilitant la classification et la clustering de données biologiques.
  • Projet dédié à l'apprentissage automatique pour calculer des distances relationnelles entre données. Il permet d'optimiser des métriques afin d'améliorer la précision des modèles de classification ou de regroupement. Utilisé dans des contextes nécessitant une analyse fine de similarités entre objets ou entités.
  • Outil en ligne de commande dédié à l'analyse de données génomiques ou de matrices de distance. Il permet de réaliser des classifications basées sur les arbres de spanning minimum (MST), de calculer des distances entre profils, de générer des arbres hiérarchiques et des statistiques pour évaluer l'efficacité des clusters. Utilisé notamment pour étudier la diversité génétique de souches bactériennes comme Bordetella ou Corynebacterium.

3 initiatives