RepeatPlot est un outil bioinformatique conçu pour analyser et visualiser les répétitions de séquences dans les chromosomes de procaryotes. Il permet de détecter les paires de régions répétées et de générer des figures graphiques en format SVG pour représenter leurs positions et similarités. L'outil facilite l'étude des mécanismes évolutifs et l'identification de motifs génomiques récurrents dans les génomes bactériens.

FRUB est un outil en ligne de commande conçu pour identifier et analyser les régions répétées au sein de séquences génomiques, notamment dans les génomes de bactériophages. Il permet de détecter des séquences similaires en utilisant des algorithmes de comparaison de séquences comme BLAST, facilitant ainsi l'étude des structures génomiques répétitives et leur annotation fonctionnelle.