Ce projet a pour but d'analyser des séquences d'ADN afin de détecter les répétitions et les motifs qui s'y trouvent. Il permet de comparer des génomes entre eux et de fournir des informations utiles pour la recherche en génomique.

Pop-Genomics est un projet dédié à l'analyse et la visualisation de données génomiques. Il permet de gérer des workflows de génomique et offre des fonctionnalités avancées de visualisation de données.

Ce projet vise à reconstruire le génome ancestral des plantes pour aider à comprendre l'évolution des génomes et à identifier les gènes clés qui ont contribué à la diversification des espèces. Il permet d'analyser les relations entre chromosomes, de valider les clusters chromosomiques et de regrouper les orthogroupes.

Ce projet vise à analyser des séquences génomiques de micro-organismes à l'aide de méthodes de métabarcoding haute fidélité. Il permet d'identifier les taxons bactériens présents dans un échantillon et d'étudier la diversité microbienne. Le projet est basé sur l'utilisation de l'outil FROGS et de méthodes d'analyse statistique.

Ce projet est un outil d'analyse de séquences biologiques. Il permet de comparer des séquences et de calculer leur similarité. Cet outil est utile pour la recherche en biologie, la génomique et la bioinformatique.

Ce projet vise à analyser et à comprendre la diversité et l'activité des communautés microbiennes marines à partir de l'étude de génomes bactériens et archéens. Il comprend la reconstruction de réseaux métaboliques, l'étude de la diversité et de l'activité des communautés, ainsi que la modélisation de l'impact des facteurs biotiques sur la structure de ces communautés.

Genometools est un projet dédié à l'analyse de données génomiques. Il permet l'identification de variations génétiques et la recherche de motifs dans des séquences d'ADN, offrant ainsi des fonctionnalités clés pour la recherche en génomique.

Ce pipeline, écrit en Perl, permet l'analyse de fragments métagénomiques dans un arbre phylogénétique basé sur un génome central, afin d'identifier les espèces connues et inconnues appartenant à un clade phylogénétique défini. Cela permet de comprendre la distribution environnementale du clade d'intérêt.

Ensemble de fonctions pour l'analyse et la visualisation de données génomiques. Permet la gestion et l'interprétation de données de séquençage grâce à une collection d'outils spécialisés.

Ce package est un outil d'aide à la préparation de données pour l'analyse de données génomiques, en particulier pour le formatage des statistiques sommaires de GWAS (Genome-Wide Association Studies) dans le format d'entrée requis par JASS. Il permet de réaligner les statistiques sommaires de GWAS sur une référence panel.