Bibliothèque C++ parallèle pour l'analyse de données multivariées de grands ensembles de données. Comprend des méthodes pour le calcul de la décomposition en valeurs singulières (SVD), la décomposition en valeurs singulières aléatoires (RSVD), l'analyse en composantes principales (PCA), l'analyse multidimensionnelle d'échelle (MDS) et l'analyse des correspondances (CoA). Gère les fichiers texte et HDF5.

Le package R {dad} fournit des outils pour créer, gérer et analyser des données de densités de probabilité. Il propose des méthodes fonctionnelles telles que l'analyse des composantes principales, l'analyse en composantes principales, l'analyse discriminante et d'autres méthodes statistiques.

Ce projet est dédié à l'apprentissage des méthodes d'exploration multidimensionnelle essentielles pour la préparation des données, telles que l'analyse en composantes principales, l'analyse discriminante linéaire, l'analyse de correspondance, la position multidimensionnelle, la factorisation non négative, etc. Il couvre également la classification non supervisée (clustering) à l'aide de k-moyennes, de l'analyse hiérarchique, de DBSCAN et de mélanges gaussiens.

Bibliothèque Python pour la réduction de dimensionnalité linéaire, permettant de calculer des méthodes telles que l'Analyse en Composantes Principales (PCA), l'Analyse Correspondance (CoA) et l'Analyse Multidimensionnelle des Échelles (MDS).

La plateforme Vidjil est composée de deux parties principales : Vidjil-algo et une application web. Vidjil-algo analyse les données de séquençage à haut débit pour extraire les jonctions V(D)J et les regrouper en clones. L'application web permet la visualisation et l'analyse interactive des clones et de leur évolution dans le temps dans un contexte de suivi de la maladie résiduelle minimale ou d'étude immunologique. Elle peut également être liée à une base de données de échantillons, d'expériences et de patients pour le stockage des données et des métadonnées, l'exécution de logiciels RepSeq et la sauvegarde d'annotations directement depuis l'application web.

La plateforme Vidjil est composée de deux parties principales : Vidjil-algo et une application web. Vidjil-algo permet d'extraire des jonctions V(D)J et de les regrouper en clones à partir de données de séquençage à haut débit. L'application web permet la visualisation et l'analyse interactives des clones et de leur suivi dans le temps dans un contexte de suivi de la maladie résiduelle minimale ou d'étude immunologique. Elle peut être liée à une base de données de échantillons, d'expériences et de patients permettant le stockage de données et de métadonnées séquence, l'exécution de logiciels RepSeq et la sauvegarde d'annotations directement depuis l'application web.

MemCAD est un analyseur statique permettant la réalisation d'une analyse de domaine abstrait composite pour les programmes C, axé principalement sur les propriétés mémoire. Il effectue une analyse avant exécution par interprétation abstraite et tente de prouver l'absence d'erreurs mémoire et de violations d'assertions.