RattleSNP est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, proposant un workflow snakemake pour le mapping de données simples ou appariées. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données biologiques grâce à matplotlib et tabulate, ainsi qu'une gestion optimisée des dépendances grâce à biopython, numpy et pandas.

Le projet cgi est une workflow d'analyse de séquences d'ADN, optimisée en termes de ressources informatiques, qui permet de définir des îlots CpG à l'aide des outils EMBOSS newcpgreport et UCSC cpg_lh, de calculer les comptages de C, G et CpG, ainsi que les rapports d'observation/attente de CpG sur des fenêtres glissantes.

Le projet rnaseq est un workflow optimisé pour l'analyse de données RNA-seq, utilisant des conteneurs Singularity pour les logiciels et le langage de description de workflow Nexflow. Il permet l'alignement de génomes et la quantification de transcrits, avec une optimisation des ressources informatiques et une utilisation sur une ferme informatique avec un scheduler Slurm.

Frangipane est un projet dédié à l'analyse et la visualisation de données biologiques, offrant une gestion simplifiée des workflows de recherche. Il permet aux scientifiques d'accélérer et d'optimiser leurs processus de recherche en fournissant des fonctionnalités d'analyse avancées et de visualisation claire et interactive.

Batsim est un simulateur de workflows informatiques permettant d'optimiser l'ordonnancement de tâches et d'analyser la consommation d'énergie des machines. Il offre une grande flexibilité dans la définition des workflows et des machines, ainsi qu'une intégration facile avec différents types de traceurs.

Ce projet vise à optimiser les workflows métier grâce à l'automatisation des tâches répétitives et à la gestion des processus d'entreprise. Il permet d'améliorer l'efficacité et la productivité en réduisant les délais de traitement et en éliminant les erreurs manuelles.