Ce projet fournit des outils bioinformatiques pour identifier et analyser les systèmes de restriction-modification (R-M) dans les génomes procaryotes. Il inclut des profils HMM dédiés aux méthyltransférases et endonucléases, ainsi que des scripts pour automatiser la recherche et l'extraction de ces systèmes à partir de fichiers protéomiques. Ces outils sont essentiels pour la génomique comparative et l'étude des mécanismes de défense bactérienne.

RepeatPlot est un outil bioinformatique conçu pour analyser et visualiser les répétitions de séquences dans les chromosomes de procaryotes. Il permet de détecter les paires de régions répétées et de générer des figures graphiques en format SVG pour représenter leurs positions et similarités. L'outil facilite l'étude des mécanismes évolutifs et l'identification de motifs génomiques récurrents dans les génomes bactériens.

Outil bioinformatique dédié à l'identification et à l'analyse des intégrons dans le génome des procaryotes. Il permet de traiter des données de séquençage (fichiers FASTQ) pour détecter des cassettes d'intégrons et générer des rapports détaillés incluant des figures et des statistiques. Utilisé principalement dans le cadre de recherches en microbiologie et génétique.