Plateforme dédiée à l'analyse et à la visualisation de données génomiques et biologiques. Elle permet aux chercheurs de collaborer, d'explorer des réseaux d'opérons et de protéines, et de publier leurs résultats sous forme de visualisations interactives. Intégrée à des outils bioinformatiques, elle facilite la compréhension des interactions moléculaires et la génération de rapports scientifiques.

Ce projet propose une suite de notebooks Jupyter dédiés à l'analyse et la visualisation de données génomiques 3D issues de fichiers Hi-C. Il permet aux chercheurs en biologie moléculaire d'explorer les interactions chromosomiques et de générer des visualisations pour leurs études. Les outils sont conçus pour être utilisés dans un cadre académique ou institutionnel, facilitant la collaboration et l'interprétation des données.

Application dédiée à l'analyse et à la visualisation de données génomiques. Elle permet aux utilisateurs d'explorer des pics sur des graphiques, de modifier interactivement les visualisations et de comparer des régions génomiques. Les données sont stockées et traitées en format HDF5, offrant une gestion efficace des informations génomiques.

Bioviz-js est une bibliothèque JavaScript dédiée à la visualisation de données biologiques complexes. Elle permet aux chercheurs et biologistes de représenter des génomes, des cladogrammes, des QTL et d'autres données génétiques sous forme de graphiques interactifs. L'outil facilite l'analyse et l'interprétation des données pour des applications en génomique, phylogénie et biologie moléculaire.

Outil dédié à l'analyse et à la visualisation de données génomiques, notamment les variations nucléotidiques (SNPs) et les délétions dans des génomes bactériens. Il permet de comparer des souches, d'identifier des mutations, de générer des cartes génomiques interactives et d'exporter des données pour des analyses approfondies. Utilisé principalement en recherche microbiologique et épidémiologie.

Outil d'analyse de séquences génomiques à la recherche de régions codantes, fournissant des résultats visuels et interactifs.

Ce projet est une bibliothèque de composants web open source dédiée à la visualisation et à l'analyse de données biologiques issues de mappings métaboliques. Il permet aux chercheurs et biologistes de générer des rapports graphiques interactifs pour explorer les enrichissements, les réactions et les voies métaboliques, facilitant ainsi l'interprétation des résultats d'études génomiques ou métabolomiques.

Orthomam Pelican est un projet de recherche visant à identifier les corrélations génomiques associées à divers phénotypes chez les mammifères. Il propose des annotations de phénotypes discrets et continus, ainsi que des outils d'analyse pour l'enrichissement fonctionnel et la visualisation de données phylogénétiques. Les résultats sont accessibles via des scripts dédiés et des carnets de notes interactifs.

Le projet pbrfrtuning est une application Shiny permettant l'analyse et la visualisation de données biologiques, en particulier de données génomiques. Il offre des fonctionnalités de comparaison et de visualisation de ces données à l'aide de graphiques interactifs et dynamiques.

Outil dédié à la visualisation et à l'analyse interactive de données génomiques directement dans un environnement Jupyter Notebook. Permet de superposer des annotations génomiques (comme des fichiers GFF) avec des séquences ADN (fichiers FASTA) pour créer des graphiques personnalisés et faciliter l'exploration des génomes.