Metage2metabo est un outil Python3 qui permet d'effectuer une analyse graphique basée sur la métabolomique à partir de génomes annotés. Il utilise Pathway Tools de manière automatique et parallèle pour reconstruire des réseaux métaboliques pour un grand nombre de génomes. Les réseaux métaboliques obtenus sont ensuite analysés individuellement et collectivement pour obtenir la valeur ajoutée de la coopération métabolique dans un microbiote par rapport à la métabolomique individuelle et pour identifier et filtrer les organismes intéressants parmi tous.