Le projet primer_design est un outil d'analyse de séquences mitochondriales permettant la conception de paires de primers spécifiques à une espèce cible pour la détection d'espèces par PCR en environnement. Il permet d'identifier les espèces cibles, d'extraire les séquences mitochondriales, de les aligner et de vérifier la spécificité des paires de primers.

Ce projet permet d'analyser la spécificité d'une paire de primers en utilisant l'outil ecoPCR pour réaliser une PCR in silico dans une base de données nucléotidique et vérifier l'amplification de séquences spécifiques à une espèce.