Environnements RStudio et Cytoscape dédiés à des ateliers de formation en bioinformatique (ETBII-2023). Ces outils permettent aux participants d'effectuer des analyses statistiques avancées, de visualiser des données biologiques complexes et d'explorer les réseaux moléculaires. Les ateliers couvrent des thématiques comme l'analyse multivariée, la génomique et l'écologie fonctionnelle.

Outil polyvalent dédié à l'analyse statistique avancée, notamment pour les modèles ANOVA et les tests de contrastes 2x2. Il permet d'automatiser des analyses de variance (univariées, multivariées, mixtes ou généralisées) et de générer des rapports HTML complets intégrant tableaux, graphiques et analyses résiduelles. Idéal pour les chercheurs et statisticiens souhaitant standardiser et documenter leurs analyses.

Ce projet fournit des outils mathématiques et statistiques dédiés aux distributions t multivariées. Il permet de calculer des distances et divergences entre ces distributions, de simuler des échantillons aléatoires et de visualiser leurs densités. Utilisé principalement dans le domaine de la recherche agronomique et statistique, il facilite l'analyse de données complexes et la modélisation probabiliste.

ExploreMetabar est une application interactive en R Shiny conçue pour analyser et explorer des données de métabarcoding (16S, ITS) issues de séquençage génomique. Elle permet aux chercheurs et biologistes de filtrer, normaliser et visualiser des données de microbiome à travers des modules dédiés à la composition taxonomique, la diversité alpha et bêta, les analyses différentielles et les statistiques multivariées. Les résultats sont exportables sous forme de tableaux, graphiques ou objets R pour une analyse approfondie.

Ce projet est une bibliothèque R dédiée à l'analyse et à la manipulation de distributions de probabilité multivariées. Il permet de calculer des divergences entre distributions (Kullback-Leibler, Renyi, Bhattacharyya, Hellinger), d'estimer des paramètres, de simuler des échantillons et de visualiser des densités de probabilité. Il couvre notamment les distributions gaussiennes, de Cauchy et de Student, et est utilisé dans des contextes de traitement du signal et de statistiques avancées.

Outil dédié à l'analyse statique des projets logiciels pour identifier des problèmes de qualité, de sécurité ou de conformité. Il permet aux équipes de développement d'automatiser les revues de code, de détecter des vulnérabilités potentielles et d'améliorer la maintenabilité des applications avant leur mise en production.