Ce projet vise à analyser et optimiser des graphes de dépendances logiciels issus de dépôts de code source. Il permet de benchmarker des pipelines de traitement, d'évaluer des jeux de données et de mesurer les performances de différents outils d'analyse. Utilisé dans un cadre académique et de recherche, il facilite la compréhension des structures de code et l'identification de points d'amélioration.

Ce projet vise à comparer les performances de plusieurs outils bioinformatiques pour analyser les données d'eDNA de poissons dans le but de construire le pipeline le plus efficace. Sept étapes de l'analyse ont été identifiées, allant de l'assemblage des paires de lectures à l'attribution taxonomique. Pour chacune de ces étapes, des programmes à comparer ont été identifiés.