Outil dédié à l'analyse des réseaux métaboliques pour déterminer les niches métaboliques d'organismes biologiques. Il permet de calculer des volumes de niche, d'optimiser des flux métaboliques et d'extraire des données structurées à partir de modèles SBML. Utilisé principalement en bioinformatique et biologie systémique pour étudier les capacités métaboliques des cellules ou organismes.

MEDUSA est une classe SAGE dédiée au calcul de la capacitance des réseaux métaboliques. Elle permet d'analyser et d'optimiser des modèles métaboliques en utilisant différents solveurs comme CPLEX, GUROBI ou GLPK. L'outil facilite l'intégration dans des environnements de calcul scientifique pour des applications en biologie systémique et en bioinformatique.