Bionano Solve est une solution logicielle dédiée au traitement et à l'analyse de données génomiques issues des technologies Bionano. Elle permet d'optimiser les calculs sur les serveurs Bionano Compute et IrysSolve, facilitant ainsi l'assemblage de génomes, la détection de variants et la génération de métriques pour des cohortes. Les outils intégrés couvrent des applications variées comme l'analyse de régions spécifiques (FSHD) ou la conversion de fichiers pour des analyses ultérieures.

CRAW (Counter RNAseq Window) est un outil bioinformatique conçu pour calculer et visualiser la couverture des expériences de séquençage ARN. Il permet d'analyser des données génomiques à partir de fichiers BAM ou WIG, en générant des rapports détaillés et des visualisations graphiques. L'outil facilite l'interprétation des données de séquençage en fournissant des métriques de couverture position par position, adaptées aux besoins de la recherche en biologie moléculaire et génomique.

Ce projet vise à calculer des métriques sur le génome du betterave à sucre à partir de données de polymorphismes nucléotidiques (SNP). Les métriques comprennent la densité de SNP, la diversité nucléotidique (pi), Tajima D et Fu et Li D. Ces métriques sont nécessaires pour valider une approche permettant de prédire la plage environnementale des phénotypes de betteraves à sucre à partir des marqueurs génétiques significativement associés à ces variables environnementales dans un ensemble indépendant d'individus.