Outil automatisé dédié à l'analyse de données génétiques pour identifier les loci associés à des traits complexes à partir de séquences Pool-Seq. Il permet de traiter des données de séquençage variées (PE, SE, SPET) et d'extraire des variants génétiques pertinents pour des études de cartographie génétique. Le pipeline génère des rapports détaillés et des visualisations pour faciliter l'interprétation des résultats.

MBMA est un outil d'analyse de microbiotes basé sur la cartographie génétique. Il permet d'identifier et de quantifier avec précision les espèces, souches et gènes de résistance présents dans des échantillons métagénomiques. Grâce à une base de données optimisée et des méthodes avancées de comptage et d'appel de variants, MBMA réduit les faux positifs et améliore la sensibilité des analyses. Il propose trois modes de fonctionnement adaptés à différents besoins : cartographie simple, cartographie avec appel de variants, et modes prédéfinis pour les espèces bactériennes ou les gènes de résistance.

Le projet kissplice2refgenome est un outil d'analyse génomique permettant l'analyse de génomes de référence, la détection de variantes génétiques et la cartographie d'assemblages génomiques. Il s'appuie sur des algorithmes avancés pour fournir des résultats précis et fiables.

Le projet cnvmap est conçu pour la détection basée sur le liaison de variations du nombre de copies (CNV) à partir des données de ségrégation des marqueurs dans les populations de cartographie génétique. Il permet une analyse robuste et précise des CNV, ce qui est crucial pour la compréhension des mécanismes sous-jacents à la variabilité génétique et à la maladie.

Vg_1.39 est un outil permettant l'analyse de données génomiques à l'aide de graphes de variations. Il offre des fonctionnalités de cartographie de variations génétiques et de génération de structures de données de graphe de variations, facilitant ainsi l'interprétation des données génomiques.