REPET-snakemake est une suite logicielle dédiée à l'identification, l'annotation et la classification des éléments transposables (transposons, rétrotransposons) dans les génomes eucaryotes. Elle permet aux chercheurs en génomique de détecter et caractériser les séquences répétées, essentielles pour comprendre l'évolution des génomes et leur impact sur la fonction des gènes. Les pipelines automatisés génèrent des rapports détaillés et des visualisations pour faciliter l'analyse des données génomiques.

Outil dédié à l'analyse et au regroupement de séquences biologiques pour faciliter l'identification de motifs, la classification de variants ou l'étude de données génomiques. Il permet aux chercheurs et biologistes de structurer et interpréter des ensembles de données complexes issus de séquences ADN ou protéiques.

Outil en ligne de commande dédié à l'analyse de données génomiques ou de matrices de distance. Il permet de réaliser des classifications basées sur les arbres de spanning minimum (MST), de calculer des distances entre profils, de générer des arbres hiérarchiques et des statistiques pour évaluer l'efficacité des clusters. Utilisé notamment pour étudier la diversité génétique de souches bactériennes comme Bordetella ou Corynebacterium.

Magneto est un pipeline automatisé pour l'analyse de données métagénomiques. Il permet la reconstruction de génomes microbiens, la classification taxonomique de séquences et l'assemblage de séquences métagénomiques.

Outil dédié à l'annotation fonctionnelle des génomes microbiens et eucaryotes. Il permet d'identifier et de classifier les gènes, de prédire leurs fonctions et de reconstruire les réseaux métaboliques. Utilisé par les chercheurs en génomique et en biologie des systèmes pour accélérer l'analyse des données génomiques et faciliter la compréhension des mécanismes biologiques sous-jacents.

Ce projet consiste en un catalogue de notebooks d'entrée de gamme dédié à la formation de professionnels de santé. Il permet la classification de médicaments et l'analyse de données médicales.