Librairie et suite logicielle dédiée à l'indexation et à l'analyse de k-mers (séquences courtes) issus de données de séquençage biologique haut débit. Elle permet de traiter de grands volumes de séquences génomiques en utilisant le protocole MPI pour une distribution efficace des calculs sur des clusters de machines. Les résultats peuvent être exploités pour des études génomiques, métagénomiques ou épidémiologiques.

Ce projet propose des outils pour analyser et comparer des profils épigénétiques à partir de fichiers BigWig. Il permet de mesurer les distances entre différents clusters de données génomiques, calculer des indices de silhouette pour évaluer la qualité des regroupements, et générer des matrices de corrélation. Les outils sont conçus pour traiter des données biologiques complexes et fournir des résultats exploitables pour la recherche en épigénétique.