MBI est un réseau montpelliérain créé en 2014 qui rassemble les acteurs de la bioinformatique, qu'ils soient issus de laboratoires académiques ou d'entreprises. Son objectif principal est de favoriser les échanges et la collaboration entre ses membres en organisant des sessions thématiques et en offrant un espace dédié aux professionnels isolés. Le réseau encourage le partage de connaissances et la mutualisation des expertises pour renforcer la communauté locale.

Plateforme dédiée à l'analyse des microbiomes marins dans le cadre de l'atelier EBAME 2019. Elle permet aux chercheurs d'explorer et d'interpréter des jeux de données complexes issus de l'écologie microbienne marine. L'environnement facilite la collaboration entre experts en biologie et en bioinformatique pour répondre à des questions biologiques significatives.

Ce projet vise à organiser des hackathons dédiés à l'analyse des pangenomes, favorisant la collaboration entre chercheurs et développeurs. Il propose des ressources documentaires et des outils pour faciliter l'exploration des données génomiques. L'objectif est de stimuler l'innovation dans le domaine de la bioinformatique en mettant à disposition des contenus pédagogiques et des environnements de travail partagés.

Plateforme cloud dédiée au Master 2 de bioinformatique de l'Université Lyon 1. Elle fournit un environnement collaboratif pour les cours, les travaux pratiques et l'analyse de données biologiques. Développée par l'équipe pédagogique et l'équipe cloud de l'IFB-core, elle facilite l'apprentissage et la recherche en bioinformatique.

VGH est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et le partage de données génomiques dans le cadre de la recherche et de l'enseignement en bioinformatique. Elle facilite la formation des utilisateurs et la collaboration entre scientifiques en proposant des outils adaptés à l'exploration et à l'interprétation des génomes.

Ce projet a pour but de faciliter la reproductibilité des workflows de bioinformatique en fournissant des environnements virtuels et en optimisant l'utilisation des ressources de calcul. Il vise également à promouvoir la réutilisabilité et la collaboration dans la recherche en bioinformatique.

Projet dédié à la création et à la diffusion d'outils bioinformatiques pour l'analyse de données biologiques. Il facilite le développement de pipelines d'analyse, la visualisation de résultats et la collaboration entre chercheurs. Les solutions proposées visent à accélérer la recherche en biologie et en génomique, en rendant les outils accessibles et réutilisables.

Outil dédié à l'automatisation et à l'optimisation de workflows scientifiques, notamment en bioinformatique. Il permet aux chercheurs de concevoir, exécuter et partager des pipelines de traitement de données génomiques ou biologiques de manière reproductible et efficace. Facilite la collaboration entre équipes en standardisant les processus analytiques.

Snakemake est un outil open source conçu pour automatiser et standardiser les pipelines d'analyse de données, notamment en bioinformatique. Il permet de définir des workflows reproductibles et modulaires pour traiter des données génomiques ou autres, en optimisant l'utilisation des ressources de calcul disponibles. Utilisé dans des environnements de recherche et de calcul intensif, il facilite la collaboration et la traçabilité des analyses scientifiques.

Plateforme open source dédiée à l'analyse et à la visualisation de réseaux d'interactions moléculaires et de voies biologiques. Elle permet d'intégrer ces réseaux avec des annotations, des profils d'expression génique et d'autres données biologiques. Accessible via un environnement de bureau à distance, elle facilite la recherche et l'exploration collaborative en bioinformatique.