Kekule.js est une bibliothèque JavaScript open source pour la chimio-informatique publiée sous licence MIT. Elle peut être utilisée dans les applications web et node.js pour lire, écrire, afficher et éditer des objets chimiques (tels que des molécules) et pour exécuter certains algorithmes chimiques (tels que la détection d'aromaticité, la comparaison et la recherche de structures moléculaires).

S-GCN est un outil spécialisé dans l'analyse et l'évaluation de structures protéiques en 3D modélisées sous forme de graphes moléculaires. Il permet de prédire des scores de qualité pour des modèles de protéines générés par des algorithmes ou des participants à des défis comme CASP. Le projet facilite la comparaison entre modèles et structures réelles, aidant ainsi les chercheurs en biologie structurale à identifier les conformations les plus proches de la réalité.

Ce projet automatise l'indexation et le contrôle qualité des génomes et annotations génétiques. Il génère des index nécessaires aux outils d'analyse en aval, évalue la qualité des assemblages génomiques via des métriques comme la complétude (BUSCO) et la contiguïté (QUAST), et produit des rapports détaillés pour faciliter la comparaison et le suivi des données génomiques. Destiné aux chercheurs et institutions en biologie moléculaire.

CoGSEA est un outil bioinformatique dédié à l'analyse comparative d'enrichissement de gènes. Il permet aux chercheurs en biologie et en génomique d'interpréter des données transcriptomiques complexes en identifiant les voies biologiques significativement enrichies. Cet outil facilite la comparaison de profils d'expression génique entre différentes conditions expérimentales, aidant ainsi à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents à des processus biologiques ou pathologiques.

MetalWalls est un logiciel de dynamique moléculaire spécialisé dans la modélisation des systèmes électrochimiques. Il permet d'appliquer un potentiel constant aux matériaux d'électrodes, facilitant ainsi l'étude des interactions entre électrolytes et surfaces chargées. Le code intègre des méthodes avancées pour simuler des environnements complexes et valider des modèles théoriques par comparaison avec des données de référence.

Outil d'analyse bioinformatique permettant d'aligner des séquences biologiques (ADN, ARN, protéines) pour identifier leurs similarités. Il génère des graphiques et des fichiers de sortie pour visualiser les relations entre séquences, facilitant ainsi la comparaison de génomes ou de protéines. Idéal pour la recherche en biologie moléculaire ou en génomique.