CoGSEA est un outil bioinformatique dédié à l'analyse comparative d'enrichissement de gènes. Il permet aux chercheurs en biologie et en génomique d'interpréter des données transcriptomiques complexes en identifiant les voies biologiques significativement enrichies. Cet outil facilite la comparaison de profils d'expression génique entre différentes conditions expérimentales, aidant ainsi à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents à des processus biologiques ou pathologiques.

Ce projet est un workflow Snakemake dédié à l'analyse phylogénétique de familles de gènes. Il permet de construire des profils HMM (Hidden Markov Models) à partir d'alignements de séquences protéiques, de rechercher ces profils dans des protéomes, et de reconstruire des arbres phylogénétiques pour étudier les relations évolutives entre espèces. Les résultats incluent des alignements multiples, des arbres phylogénétiques et des statistiques associées, facilitant la comparaison des génomes et l'identification de gènes d'intérêt.