MetExplore 3 Java est une plateforme dédiée à l'analyse et à l'exploration des réseaux métaboliques. Elle permet aux chercheurs et biologistes de charger, visualiser et analyser des données issues de bases de données biologiques comme KEGG ou ChEBI. L'outil facilite l'intégration de réseaux métaboliques, la comparaison de voies métaboliques et la gestion de collections de données pour des études en métabolomique et biologie des systèmes.

MajS est un outil dédié à l'analyse et à la comparaison de réseaux biologiques, notamment pour l'étude des voies de signalisation et des prédictions de nœuds biologiques. Il permet de générer des solutions optimales à partir de règles logiques appliquées à des instances biologiques, facilitant ainsi la validation et l'interprétation des modèles. Les résultats sont utilisés pour comparer les performances avec d'autres outils comme Iggy.

Le projet atelier_inference_reseaux permet l'analyse et l'inférence de réseaux biologiques à partir de données génomiques. Il offre des fonctionnalités de visualisation et de comparaison de réseaux, ainsi que des outils pour faciliter l'interprétation des résultats.

Outil dédié à la standardisation et à la comparaison de réseaux métaboliques. Il permet d'identifier les différences entre un réseau cible et un réseau de référence en analysant les métabolites et les réactions. Le projet génère des fichiers de correspondance, des scores de similarité et des listes d'entités uniques ou divergentes, facilitant ainsi la normalisation des données biologiques.