Outil dédié à l'analyse approfondie de données issues du séquençage RNA (RnaSeq). Il permet aux chercheurs et biologistes d'interpréter les résultats de séquençage en générant des rapports détaillés sur l'expression des gènes. Le script facilite la comparaison entre différents échantillons et génotypes, aidant ainsi à identifier des variations biologiques ou des réponses à des traitements.

Ce projet académique compare différentes méthodes de clustering (k-means, classification hiérarchique, clara, EM) appliquées à des données de transcriptomique. L'objectif est d'identifier des groupes de gènes corrélés pour comprendre des phénomènes de co-régulation ou d'association à des maladies. Les résultats sont analysés et comparés entre méthodes, puis enrichis via des ontologies de gènes pour évaluer leur pertinence biologique. Des visualisations et rapports détaillés sont générés pour faciliter l'interprétation des données.

MajS est un outil dédié à l'analyse et à la comparaison de réseaux biologiques, notamment pour l'étude des voies de signalisation et des prédictions de nœuds biologiques. Il permet de générer des solutions optimales à partir de règles logiques appliquées à des instances biologiques, facilitant ainsi la validation et l'interprétation des modèles. Les résultats sont utilisés pour comparer les performances avec d'autres outils comme Iggy.

GenoFig est un outil dédié à la visualisation graphique de régions génomiques annotées et à la comparaison de régions homologues entre séquences génétiques. Il permet aux chercheurs et biologistes de générer des figures claires et personnalisables pour illustrer des données génomiques, facilitant ainsi l'analyse et la présentation des résultats scientifiques. L'application prend en charge les formats GenBank et FASTA, et offre des fonctionnalités avancées pour mettre en évidence des gènes ou des caractéristiques spécifiques.

Le projet atelier_inference_reseaux permet l'analyse et l'inférence de réseaux biologiques à partir de données génomiques. Il offre des fonctionnalités de visualisation et de comparaison de réseaux, ainsi que des outils pour faciliter l'interprétation des résultats.