Gatb-rconnector est un outil bio-informatique permettant l'analyse de données génomiques. Il permet la comparaison de séquences d'ADN et l'indexation de génomes de référence, facilitant ainsi la recherche de similarités entre séquences. Cet outil est basé sur une approche probabiliste et permet une utilisation efficace des ressources.

GenoLayout est un programme en ligne de commande écrit en Bash permettant de créer des figures SVG représentant des cartes linéaires de fragments conservés entre génomes. Il s'appuie sur des outils tels que gawk et blast+ pour le traitement et la comparaison des séquences.

D-GENIES est un outil d'analyse de génomes permettant la comparaison de séquences et la visualisation d'alignements de génomes entiers. Il est basé sur le logiciel minimap2 et offre une interface interactive pour zoomer et télécharger différents fichiers d'image, d'alignement ou de séquences. D-GENIES est open source et disponible en installation locale.

Whatshap est un outil en développement permettant de gérer et visualiser des variations génomiques. Il facilite la résolution de conflits dans les comparaisons génomiques et permet l'intégration de données de séquençage génomique.

Samtools est un ensemble d'outils conçus pour gérer et analyser les fichiers SAM, BAM et CRAM, largement utilisés dans le traitement des données de séquençage génomique. Il permet de visualiser, filtrer et trier ces données, ainsi que de réaliser différents types de calculs et de comparaisons.