Caulifinder est un outil permettant de découvrir des séquences de Caulimoviridae dans les génomes végétaux. Il est composé de deux branches avec des objectifs complémentaires : la branche A construit des séquences consensus des Caulimoviridae endogènes et la branche B produit une analyse phylogénétique des gènes marqueurs.

Outil dédié à l'analyse de séquences biologiques pour identifier des consensus moléculaires. Permet de comparer des données génétiques et d'extraire des motifs communs entre plusieurs séquences. Utilisé principalement dans le domaine de la bioinformatique pour faciliter la recherche et l'interprétation de données génomiques.

Outil bioinformatique conçu pour extraire une séquence ADN à partir de lectures en appliquant une stratégie de consensus sur plusieurs alignements multiples (MSA). Il génère un méta-MSA à partir des consensus intermédiaires, puis applique à nouveau la stratégie pour produire un méta-consensus final. Utilisé pour analyser des données génomiques complexes et améliorer la précision des séquences consensus.