Orthofinder2JSON-Graph est un outil spécialisé dans la conversion des résultats d'Orthofinder au format JSON, optimisé pour une visualisation sous forme de graphes. Il transforme les données d'orthologie en structures accessibles, facilitant ainsi l'interprétation des relations entre protéines et espèces. Ce projet s'adresse principalement aux chercheurs en bioinformatique et en biologie évolutive souhaitant analyser et visualiser des ensembles de gènes orthologues.

SeqKit est un outil bioinformatique multiplateforme et ultra-rapide conçu pour manipuler des fichiers de séquences biologiques au format FASTA ou FASTQ. Il permet d'effectuer des opérations courantes comme le filtrage, le tri, la conversion ou l'extraction de séquences, facilitant ainsi l'analyse et le traitement de données génomiques à grande échelle.

Outil permettant de transformer des fichiers SBML (Systems Biology Markup Language) en format JSON compatible avec des outils de visualisation de réseaux métaboliques comme MetExploreViz. Il facilite l'analyse et la représentation graphique des voies métaboliques pour les biologistes et bioinformaticiens, en automatisant la conversion des données et en générant des structures exploitables par des logiciels spécialisés.