PLMdetect est un outil développé depuis 2010 permettant la détection de motifs sur-représentés à une distance spécifique du site de démarrage ou d'arrêt de la transcription dans des séquences d'ADN. Il a été utilisé dans plusieurs études pour l'analyse de régions promotrices de gènes et la recherche de motifs impliqués dans la régulation de la transcription.

Ce projet permet de reproduire des expériences visant à détecter des réinitialisations dans les réseaux de régulation génique à partir de données d'expression génique unicellulaire. Il fournit des outils pour analyser des jeux de données biologiques et générer des visualisations associées, facilitant ainsi la recherche en biologie computationnelle et en génomique.

DeepSTR est un projet d'analyse et de prédiction de l'impact fonctionnel des variations du génome, en particulier les variations répétitives (STR). Il inclut des algorithmes de machine learning et de fouille de données pour détecter des motifs dans les séquences d'ADN et prédire leur impact sur la régulation génique.

En-WDM est un simulateur avancé de mobilité humaine conçu pour modéliser finement les déplacements quotidiens et les interactions sociales. Il étend le modèle WDM en intégrant des profils de mobilité personnalisés (scouteurs, réguliers, routiniers) et des dynamiques urbaines réalistes. Utilisé pour des recherches sur les réseaux sans fil et la détection de fraudes, il génère des traces de mobilité détaillées adaptées à des études scientifiques.