Starphylo est un pipeline bioinformatique conçu pour analyser des séquences génomiques de virus et estimer des paramètres épidémiologiques clés comme le taux de reproduction (R0) ou le taux de retrait des individus infectés. Il permet d'étudier des virus comme le SARS-CoV-2, la grippe ou le VRS, en combinant des approches bayésiennes, de maximum de vraisemblance et d'apprentissage profond pour fournir des analyses robustes et adaptées aux besoins de surveillance épidémiologique.