Taskflow_jobs est un projet dédié à la gestion de workflows de traitement de données, à l'automatisation de tâches analytiques et à l'orchestration de pipelines de données. Il permet l'intégration de différents services de traitement de données et offre une interface unifiée pour gérer et exécuter des workflows analytiques complexes.

Le projet wgs_gatk est un pipeline de traitement de données de séquençage d'ADN en mode paired-end Illumina. Il permet de passer des données brutes au format fastq à un fichier vcf contenant les variations génétiques identifiées, en suivant les bonnes pratiques de GATK. Le pipeline est géré par Snakemake et utilise SLURM pour l'exécution parallélisée des tâches.

Ce projet est un pipeline Nextflow pour l'harmonisation, l'imputation et l'analyse conjointe de statistiques de GWAS. Il intègre des workflows pour le prétraitement des données, l'imputation des données manquantes et l'analyse conjointe des traits. Le pipeline est conçu pour être exécuté de manière efficace sur des données multi-traits.