Ce projet permet de gérer des files d'attente de calculs sur un supercalculateur en utilisant Slurm. Il offre la possibilité d'exécuter des tâches de traitement parallèle et d'optimiser les performances des calculs scientifiques.

Le projet wgs_gatk est un pipeline de traitement de données de séquençage d'ADN en mode paired-end Illumina. Il permet de passer des données brutes au format fastq à un fichier vcf contenant les variations génétiques identifiées, en suivant les bonnes pratiques de GATK. Le pipeline est géré par Snakemake et utilise SLURM pour l'exécution parallélisée des tâches.