ExploreMetabar est une application interactive en R Shiny conçue pour analyser et explorer des données de métabarcoding (16S, ITS) issues de séquençage génomique. Elle permet aux chercheurs et biologistes de filtrer, normaliser et visualiser des données de microbiome à travers des modules dédiés à la composition taxonomique, la diversité alpha et bêta, les analyses différentielles et les statistiques multivariées. Les résultats sont exportables sous forme de tableaux, graphiques ou objets R pour une analyse approfondie.

Outil de visualisation dédié à l'analyse de données issues du séquençage ARN à haut débit en cellule unique (single-cell RNA-seq). Il permet aux chercheurs en biologie et en cancérologie de visualiser et d'explorer interactivement des résultats complexes, facilitant ainsi l'interprétation des données et la génération d'hypothèses pour des études sur le myélome multiple et d'autres pathologies.

SingR est une application locale dédiée à l'analyse et à la visualisation de données de séquençage ARN simple cellule (scRNA-seq). Elle permet aux chercheurs d'explorer la composition des échantillons cellulaires, d'évaluer la qualité des données, de comparer l'expression génétique entre groupes, et d'identifier des voies biologiques enrichies. L'outil intègre des fonctionnalités de visualisation avancées (UMAP, t-SNE, PCA) et des tests statistiques pour faciliter l'interprétation des résultats biologiques.

Plateforme dédiée à la formation et à l'analyse de données de séquençage ADN. Elle permet aux utilisateurs d'apprendre et de manipuler des outils bioinformatiques via une interface accessible basée sur Galaxy, facilitant ainsi l'exploration des données génomiques.

Outil bioinformatique dédié à l'analyse des données de séquençage ARN pour étudier l'épissage alternatif. Il permet d'identifier et de quantifier les variants d'épissage dans différentes conditions biologiques, facilitant ainsi la compréhension des mécanismes de régulation génétique. Utilisé par des chercheurs en biologie moléculaire et génomique pour explorer les liens entre épissage alternatif et maladies, notamment le cancer.

SingR est une application de bureau conçue pour faciliter l'analyse et la visualisation de données de séquençage ARN à cellule unique (scRNA-seq). Elle permet aux chercheurs, même sans compétences en programmation, d'explorer des jeux de données, de vérifier les contrôles qualité, de visualiser les clusters cellulaires, d'identifier les gènes différentiels et d'analyser les voies biologiques enrichies. L'outil propose des interfaces intuitives pour générer des graphiques personnalisables et téléchargeables, ainsi que des analyses statistiques intégrées pour interpréter les résultats biologiques.

Ce projet concerne l'espèce de levure Torulaspora microellipsoides et plus spécifiquement la souche CLIB 830. Il contient les données de séquençage de son génome et offre la possibilité de l'explorer et de l'analyser. Ce projet peut être utilisé par les chercheurs en génétique et en génomique pour en apprendre davantage sur cette espèce de levure.