Outil dédié à la visualisation et à l'analyse interactive de données génomiques directement dans un environnement Jupyter Notebook. Permet de superposer des annotations génomiques (comme des fichiers GFF) avec des séquences ADN (fichiers FASTA) pour créer des graphiques personnalisés et faciliter l'exploration des génomes.

Le projet exploremetabar-docker est une recette Docker pour une application Shiny permettant l'analyse et la visualisation de métabars, des barres de séquences d'ADN utilisées dans l'étude de la biodiversité environnementale.

Plateforme dédiée à la formation et à l'analyse de données de séquençage ADN. Elle permet aux utilisateurs d'apprendre et de manipuler des outils bioinformatiques via une interface accessible basée sur Galaxy, facilitant ainsi l'exploration des données génomiques.

Ce projet est dédié à l'apprentissage des méthodes d'exploration multidimensionnelle essentielles pour la préparation des données, telles que l'analyse en composantes principales, l'analyse discriminante linéaire, l'analyse de correspondance, la position multidimensionnelle, la factorisation non négative, etc. Il couvre également la classification non supervisée (clustering) à l'aide de k-moyennes, de l'analyse hiérarchique, de DBSCAN et de mélanges gaussiens.

Ce projet permet d'explorer et d'analyser des scénarios concurrents dans des systèmes multi-threads. Il offre des fonctionnalités de génération de modèles et de simulation de ces systèmes.