Annuaire des initiatives

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  • Extension pour le logiciel Icy dédiée à l'analyse d'images biologiques. Elle permet de combler automatiquement les trous présents dans les régions d'intérêt (ROI) des séquences d'images, facilitant ainsi l'étude des structures cellulaires ou tissulaires. Développée par des membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, cette solution s'intègre dans un écosystème open source pour la recherche en imagerie médicale et biologique.
  • Notoriété 7 %
    Extension logicielle conçue pour enrichir les fonctionnalités du logiciel d'analyse d'images biologiques Icy. Elle propose des outils avancés pour le dessin et la gestion des régions d'intérêt (ROI), ainsi que des solutions pour l'importation et la visualisation de fichiers d'images complexes comme ceux au format LOCI. Développée par des membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, cette extension facilite le traitement et l'analyse des images microscopiques dans un cadre de recherche biomédicale.
  • Kernel Extension est une extension dédiée à l'analyse d'images biologiques pour le logiciel Icy. Elle fournit des outils essentiels comme des canvas 2D, des outils de dessin de régions d'intérêt (ROI), des descripteurs de ROI et un importateur de fichiers LOCI. Développée par des membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, cette extension s'intègre parfaitement dans l'écosystème Icy pour enrichir ses fonctionnalités et faciliter le traitement des images scientifiques.
  • Extension logicielle dédiée à l'analyse d'images biologiques, permettant de visualiser des données multicanaux sous forme de montage. Chaque canal est affiché séparément avec une option de fusion en couleur pour faciliter la création de figures destinées à la communication scientifique ou à l'analyse visuelle. Intégré à Icy, un logiciel open source de bio-imagerie développé à l'Institut Pasteur, il s'adresse aux chercheurs et biologistes pour optimiser leur workflow d'analyse d'images.
  • Extension logicielle dédiée à l'analyse d'images biologiques, permettant de générer des vidéos de rotation à 360 degrés d'un volume 3D visualisé dans un logiciel de bioimagerie. Développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, elle s'intègre à Icy, une plateforme open source pour la recherche reproductible en imagerie cellulaire et moléculaire.
  • Notoriété 7 %
    Extension logicielle conçue pour enrichir les fonctionnalités du logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Elle permet aux chercheurs et biologistes d'étendre les capacités de traitement et de visualisation des images microscopiques, facilitant ainsi l'analyse avancée des données bioimage dans un cadre académique ou industriel.
  • Extension logicielle dédiée à la coloration automatique des pistes (trajectoires) dans le gestionnaire de pistes de l'outil Icy. Conçue pour les biologistes et chercheurs en imagerie médicale, elle facilite l'analyse visuelle des trajectoires cellulaires ou moléculaires en attribuant des couleurs distinctes selon des critères prédéfinis ou aléatoires. Intégrée à une suite d'outils open source pour l'analyse d'images biologiques, elle s'inscrit dans un écosystème académique et scientifique.
  • Extension logicielle dédiée à l'analyse d'images biologiques, intégrée à la plateforme Icy. Elle permet de calculer des enveloppes convexes pour des ensembles de points en deux ou trois dimensions. Utilisée principalement en imagerie médicale et en bioinformatique, elle facilite la modélisation géométrique et l'analyse de structures biologiques complexes. Développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, elle s'intègre comme un outil complémentaire pour les chercheurs et biologistes.
  • EzPlug est une extension pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, conçue pour faciliter le développement d'extensions par des chercheurs ou développeurs. Elle automatise la génération d'interfaces graphiques riches et intuitives à partir des paramètres d'algorithmes, permettant une intégration rapide et efficace d'outils d'analyse d'images dans l'écosystème Icy.
  • BlockVars est une extension pour le logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Ce plugin propose des outils pour simplifier la gestion des variables couramment utilisées dans les protocoles de bioanalyse. Il permet de définir et manipuler des dimensions, des points et des rectangles, facilitant ainsi la création et l'exécution de workflows automatisés. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, il s'intègre parfaitement dans l'écosystème Icy pour répondre aux besoins des chercheurs en imagerie cellulaire et moléculaire.

36 initiatives