Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
- Ministère des Armées et des Anciens combattants
- Mairie - Paris - Hôtel-de-Ville
Notoriété 10 %SCALPEL3 est un framework open-source conçu pour extraire des concepts médicaux de manière évolutive, reproductible et facile à partir de grandes bases de données observationales (LODs), avec un focus actuel sur les données du Système National des Données de Santé (SNDS) français. Il est basé sur PySpark et est composé de trois modules : SCALPEL-Flattening pour la dénormalisation des données, SCALPEL-Extraction pour l'extraction de concepts médicaux et SCALPEL-Analysis pour l'analyse de données de cohortes.- Ce projet automatise l'extraction et la structuration des informations médicales contenues dans les Résumés des Caractéristiques du Produit (RCP) des médicaments. Il permet de transformer des fichiers HTML en données exploitables pour des analyses statistiques, des rapports ou des intégrations dans des pipelines de données. L'objectif est de faciliter l'accès et l'exploitation des données réglementaires des médicaments pour les professionnels de santé ou les organismes publics.
- Notoriété 7 %Service public permettant d'extraire des données géographiques depuis la Géoplateforme. Il offre une interface pour configurer des extractions selon des critères spatiaux, thématiques ou temporels, puis de suivre leur avancement. Les résultats peuvent être téléchargés ou intégrés dans des documents historiques pour un usage ultérieur.
- Ce projet permet d'extraire et d'analyser des données génomiques à partir de graphes de pangenome (GFA). Il facilite l'identification des nœuds spécifiques à des haplotypes, la génération de matrices de présence/absence, et la conversion de formats pour des analyses comparatives. Les outils intégrés permettent de manipuler des régions génomiques ciblées et de produire des fichiers VCF pour étudier les variations entre individus ou populations.
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