SCALPEL-Extraction est une bibliothèque du framework SCALPEL3, résultant d'un partenariat de recherche entre l'École Polytechnique et la Caisse Nationale d'Assurance Maladie. Elle fournit des extracteurs de concepts permettant de récupérer des événements médicaux et des patients significatifs à partir des données du Système National des Données de Santé (SNDS). Cette bibliothèque est basée sur Apache Spark et lit des données aplaties résultant de l'exécution de SCALPEL-Flattening sur des données SNDS brutes, pour ensuite extraire des `Patients` et des `Events` en trois étapes.

Le projet Gildas est un conteneur Docker basé sur Debian Bullseye qui permet d'exécuter l'application Gildas avec son interface graphique. Il est utilisé pour l'analyse de données scientifiques en astronomie, en particulier pour l'extraction de données à partir de cubes astronomiques. Le conteneur inclut des scripts pour extraire des données à partir de datacube pour des tests. Il permet de monter deux volumes : /data pour les données scientifiques et /maps pour les scripts .map de Gildas.

Le projet psc-extract permet d'extraire des données depuis une base MongoDB et de générer des fichiers à partir de ces données. Il s'agit également d'un serveur web qui expose les fichiers générés pour permettre leur téléchargement.

SCALPEL3 est un framework open-source conçu pour extraire des concepts médicaux de manière évolutive, reproductible et facile à partir de grandes bases de données observationales (LODs), avec un focus actuel sur les données du Système National des Données de Santé (SNDS) français. Il est basé sur PySpark et est composé de trois modules : SCALPEL-Flattening pour la dénormalisation des données, SCALPEL-Extraction pour l'extraction de concepts médicaux et SCALPEL-Analysis pour l'analyse de données de cohortes.

Le projet periscope-indexing-ws est un service web d'indexation dédié à l'application Périscope. Il assure l'indexation de notices bibliographiques, l'extraction de métadonnées à partir de notices XML, la gestion de l'accès aux notices via Solr et l'importation de données depuis une base de données Oracle.

Service d'analyse en text mining sur Migale dédié aux sciences de la vie. Il offre une collaboration et un accompagnement sur demande pour des mini-projets d'extraction d'informations à partir de textes bruts issus de la littérature scientifique ou de bases de données en bioinformatique. Les projets d'analyse doivent correspondre à des applications du text mining pour les sciences de la vie et visent la constitution de corpus textuels thématiques, l'extraction d'entités nommées et la classification d'informations textuelles.

Edspdf-mupdf est une bibliothèque Python qui fournit un composant de traitement de PDF basé sur MuPdf pour EDSPDF, facilitant l'analyse et l'extraction de données à partir de PDF dans des contextes médicaux et de recherche.