Extension dédiée à la création, l'édition et l'analyse de régions d'intérêt (ROI) en trois dimensions pour l'imagerie biologique. Elle permet aux chercheurs de manipuler des maillages polygonaux (surfaces) et polyédriques (volumes) pour segmenter, analyser et visualiser des structures biologiques complexes dans des images 3D. Intégrée à la plateforme Icy, elle facilite l'extraction de masques binaires et l'export de données pour des analyses quantitatives avancées.

Outil dédié à la conversion, l'analyse et la segmentation de données microscopiques au format ND2. Permet de transformer des images brutes en fichiers TIFF optimisés pour l'analyse scientifique. Offre des fonctionnalités avancées de traitement d'images pour l'étude d'organoïdes et de cellules, ainsi que des outils d'extraction de métriques quantitatives pour la recherche biomédicale.

Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de traiter et d'analyser les trajectoires d'objets (comme des cellules ou des particules) dans des séquences d'images microscopiques. L'outil facilite l'extraction de régions d'intérêt (ROI) et l'application de filtres pour affiner les données avant leur analyse quantitative. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour étudier les mouvements cellulaires ou moléculaires.

Zellige est un outil logiciel dédié à l'extraction automatisée de surfaces multiples et variées à partir d'images 3D acquises par microscopie de fluorescence. Il permet de segmenter et projeter plusieurs surfaces d'intérêt dans un même volume, même en présence de textures, contrastes ou inclinaisons variables. Conçu pour les biologistes et chercheurs, il facilite l'analyse quantitative des tissus épithéliaux en générant des projections 2D précises à partir de données 3D complexes.

Outil spécialisé dans la manipulation et l'édition de masques binaires appliqués à des images biologiques ou médicales. Il permet aux chercheurs et biologistes de segmenter, modifier et analyser des régions d'intérêt dans des images, facilitant ainsi l'extraction de données quantitatives pour des études scientifiques. Intégré à la plateforme Icy, il s'adresse principalement aux utilisateurs travaillant dans le domaine de l'imagerie cellulaire ou moléculaire.

Bibliothèque Python pour la détection et l'extraction de données quantitatives à partir d'images de noyaux cellulaires en microscopie.

Ce projet automatise l'extraction et la structuration des informations médicales contenues dans les Résumés des Caractéristiques du Produit (RCP) des médicaments. Il permet de transformer des fichiers HTML en données exploitables pour des analyses statistiques, des rapports ou des intégrations dans des pipelines de données. L'objectif est de faciliter l'accès et l'exploitation des données réglementaires des médicaments pour les professionnels de santé ou les organismes publics.