Outil dédié à l'extraction et à l'analyse de données biologiques issues de sources variées comme GBIF ou TaxRef. Il permet de scraper des occurrences d'espèces, de gérer des médias associés et de générer des visualisations dynamiques. Idéal pour les chercheurs ou institutions souhaitant exploiter des données taxonomiques pour des études environnementales ou scientifiques.

Outil dédié à l'extraction et à l'analyse de données génomiques à partir de fichiers VCF. Il permet aux chercheurs et biologistes de traiter des données génétiques pour identifier des variants, des mutations ou des annotations spécifiques. Facilite la manipulation de grands jeux de données génomiques pour des études scientifiques ou médicales.

Projet dédié à la segmentation et au suivi automatisé de cellules embryonnaires à partir d'images scientifiques. Il combine des algorithmes avancés pour identifier et analyser les cellules en développement, facilitant ainsi la recherche en biologie cellulaire et en imagerie médicale. Les outils développés permettent une extraction précise des données cellulaires et une visualisation des résultats.

Mustic est une plateforme logicielle dédiée à l'analyse et au traitement d'images scientifiques, notamment pour les données géospatiales et médicales. Elle permet aux chercheurs et ingénieurs de segmenter, classifier et visualiser des données complexes à partir d'images ou de séries de données. L'outil intègre des fonctionnalités avancées pour l'extraction d'informations et la génération de rapports analytiques.

FODOMUST est une bibliothèque open source dédiée au traitement et à l'analyse d'images, notamment pour des applications scientifiques et médicales. Elle propose des outils avancés pour la segmentation, la reconstruction 3D, l'analyse de données géospatiales et la classification d'images. Utilisée dans des projets de recherche et d'ingénierie, elle facilite l'extraction d'informations pertinentes à partir d'images complexes.

Boîte à outils dédiée à l'analyse d'images biologiques et médicales, intégrée au logiciel Icy. Elle fournit des fonctionnalités avancées pour le traitement, la segmentation et l'extraction de caractéristiques d'images, facilitant ainsi la recherche en bio-imagerie. Utilisée par des scientifiques pour automatiser des analyses complexes et améliorer la reproductibilité des résultats.

Outil spécialisé dans la manipulation et l'édition de masques binaires appliqués à des images biologiques ou médicales. Il permet aux chercheurs et biologistes de segmenter, modifier et analyser des régions d'intérêt dans des images, facilitant ainsi l'extraction de données quantitatives pour des études scientifiques. Intégré à la plateforme Icy, il s'adresse principalement aux utilisateurs travaillant dans le domaine de l'imagerie cellulaire ou moléculaire.

Le projet pubmed-utils fournit des scripts utilitaires pour manipuler des fichiers XML PubMed, facilitant ainsi l'extraction et l'analyse de données médicales et de littérature scientifique.