HELIX est une plateforme open source développée par l'AP-HP dédiée à la recherche clinique et aux environnements de données de santé. Elle permet de déployer de manière sécurisée et conteneurisée des outils et applications pour faciliter l'analyse de données médicales, la collaboration entre chercheurs et l'innovation en santé. La solution est conçue pour être facilement déployable sur Kubernetes, offrant une flexibilité adaptée aux besoins des laboratoires et des environnements de recherche.

Ce projet propose des ressources et outils pour la formation en biostatistiques, visant à soutenir les chercheurs, étudiants et professionnels de la santé dans l'analyse de données biologiques et médicales. Il facilite l'apprentissage des méthodes statistiques appliquées à la recherche biomédicale et encourage la collaboration entre équipes scientifiques.

Ce projet fournit des environnements Jupyter préconfigurés et sécurisés, spécialement conçus pour la recherche en santé et les data scientists travaillant sur des entrepôts de données médicales (EDS). Il standardise les outils, les dépendances et les bonnes pratiques pour garantir la reproductibilité, la sécurité et la collaboration dans l'analyse de données cliniques. Intégré à l'écosystème HELIX, il facilite l'accès aux données tout en respectant les contraintes de gouvernance et de conformité.

Montage 2D est un plugin pour le logiciel d'analyse bioimage Icy, développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Il permet aux chercheurs et biologistes de créer des montages d'images 2D à partir de données microscopiques, facilitant ainsi l'analyse et la visualisation de leurs échantillons biologiques. Le plugin s'intègre directement dans l'écosystème Icy, offrant une solution open source et collaborative pour la recherche en imagerie médicale.