Bibliothèque partagée dédiée à la gestion de pipelines et de tâches pour l'analyse d'images biologiques. Elle permet d'automatiser des workflows scientifiques complexes, de suivre la progression des calculs et de gérer les dépendances entre tâches. Intégrée à des logiciels comme Icy, elle facilite la reproductibilité et l'efficacité des analyses bioinformatiques.

Ce projet fournit des fichiers Dockerfiles pour générer des images Docker hébergées sur Docker Hub. Ces images sont conçues pour des environnements bioinformatiques, notamment pour des analyses génomiques et biostatistiques. Elles intègrent des logiciels scientifiques comme R, Python, et des outils spécialisés (ex : immcantation, smrt, Jalview), facilitant la reproductibilité des analyses dans le domaine de la recherche académique et médicale.

Ce projet fournit des wrappers pour Snakemake, un outil d'automatisation des workflows bioinformatiques. Il facilite le traitement et l'analyse de données de séquençage haut débit en standardisant les pipelines. Les wrappers permettent d'intégrer facilement des étapes comme le mappage sur un génome, le comptage de lectures ou la génération de statistiques. Le tout est conçu pour être réutilisable et modulaire, améliorant ainsi la reproductibilité et l'efficacité des analyses génomiques.

Ce projet propose des utilitaires pour automatiser et optimiser des workflows scientifiques, notamment dans le domaine de la bioinformatique. Il facilite la création, l'exécution et le suivi de pipelines de traitement de données, en réduisant les tâches répétitives et en améliorant la reproductibilité des analyses.