Extension pour le logiciel Icy dédiée à l'analyse d'images biologiques. Spot Detector permet de détecter et compter automatiquement des spots (noyaux, cellules) dans des images 2D ou 3D, souvent bruitées. Il offre des fonctionnalités de filtrage, de tri par régions d'intérêt et d'export des données en fichiers Excel. Utilisé principalement en imagerie cellulaire et microscopie, il facilite l'analyse quantitative des images issues de la recherche biomédicale.

Seqtk est un outil léger et rapide pour le traitement de séquences biologiques au format FASTA ou FASTQ. Il prend en charge la lecture des deux formats de fichiers, qui peuvent être compressés avec gzip. Il est utilisé dans l'analyse de données biologiques, telles que l'alignement de séquences, le filtrage de données, etc.

Ce projet propose des composants web pour afficher et interagir avec des données biologiques et des réseaux métaboliques. Il permet de visualiser des informations structurées comme les métabolites, enzymes ou gènes, et facilite l'exploration de données issues de bases de données biologiques ou fournies localement. Les outils intégrés offrent des fonctionnalités de filtrage, de sélection et d'analyse pour soutenir la recherche en bioinformatique.

Filtlong est un outil en développement conçu pour faciliter le filtrage et le tri d'ensembles de données biologiques. Il permet de réduire la complexité des données de séquençage et d'améliorer l'efficacité des analyses de données génomiques.

Le projet nanofilt est un package dédié au filtrage et au recadrage des données de séquençage Oxford Nanopore. Il permet de traiter et d'analyser des données biologiques grâce à une image Singularity.

SeqKit est un outil bioinformatique multiplateforme et ultra-rapide conçu pour manipuler des fichiers de séquences biologiques au format FASTA ou FASTQ. Il permet d'effectuer des opérations courantes comme le filtrage, le tri, la conversion ou l'extraction de séquences, facilitant ainsi l'analyse et le traitement de données génomiques à grande échelle.