Seqtk est un outil léger et rapide pour le traitement de séquences biologiques au format FASTA ou FASTQ. Il prend en charge la lecture des deux formats de fichiers, qui peuvent être compressés avec gzip. Il est utilisé dans l'analyse de données biologiques, telles que l'alignement de séquences, le filtrage de données, etc.

Filtlong est un outil en développement conçu pour faciliter le filtrage et le tri d'ensembles de données biologiques. Il permet de réduire la complexité des données de séquençage et d'améliorer l'efficacité des analyses de données génomiques.

Le projet nanofilt est un package dédié au filtrage et au recadrage des données de séquençage Oxford Nanopore. Il permet de traiter et d'analyser des données biologiques grâce à une image Singularity.