VCFtools est un ensemble d'outils en ligne de commande permettant d'effectuer des analyses sur des données de variation génétique au format VCF. Il permet de filtrer, d'extraire des statistiques et de convertir des fichiers VCF, ainsi que de manipuler des données associées.

Le projet CHI-KNOW-PO a pour objectif d'identifier des schémas de co-occurrence de champs lexicaux et de emprunts textuels à travers les genres dans la Chine médiévale, en se concentrant plus spécifiquement sur les plantes parmi d'autres thèmes. Le projet se déroule en trois étapes : la numérisation, l'édition et la publication d'une corpus d'anthologies poétiques, de commentaires, de dictionnaires, d'encyclopédies et de traités pratiques de la période médiévale chinoise (environ 200-1000 apr. J.-C.) ; la création d'une base de données avec des informations bio-bibliographiques et sémantiques utiles pour des fins d'édition et d'exploration de textes ; et le développement de scripts permettant d'effectuer des recherches, des filtres et des analyses statistiques personnalisés pour étudier la co-occurrence de mots et de groupes de mots dans des textes donnés et identifier d'éventuels cas de réutilisation textuelle.

L'application « Autorité environnementale en Pays de la Loire » affiche les données de suivi des avis et décisions de l'Autorité environnementale en Pays de la Loire par millésime. Elle propose des rubriques telles que les chiffres-clés, les bilans d'activité, les statistiques, les évolutions, l'aide, le développement et les mentions légales. Elle est accessible via l'Intranet de la DREAL et propose des fonctionnalités telles que la recherche plein texte, le tri et le filtre par colonne, et l'export de données.

Petit script permettant de générer des statistiques à partir d'une liste de métiers, offrant ainsi une analyse de données sur l'emploi et la possibilité de créer des rapports sur les tendances professionnelles.

Ce projet concerne l'analyse de données génomiques de trois espèces de poissons méditerranéens : mullus surmuletus, diplodus sargus et serranus cabrilla. Il comprend des scripts et des outils pour le filtrage des données SNPs, la description des SNPs sur le génome, le calcul de la distance moyenne entre les SNPs et le comptage des SNPs situés dans ou en dehors des régions codantes et mitochondriales.

Ce projet permet la visualisation et l'exportation de données statistiques. Il offre des fonctionnalités de filtrage et de tri pour faciliter l'analyse des données. Les données peuvent être exportées au format CSV pour une utilisation dans d'autres outils d'analyse.

Ce projet permet de générer des statistiques de fréquentation de portails éducatifs en important des données mensuelles. Il offre une interface de visualisation de données filtrables par type d'établissement et par mois.

FLORA est un workflow FAIR et évolutif permettant l'analyse de données RNAseq du projet AMOCYST en utilisant des outils et des méthodes statistiques de pointe en transcriptomique pour effectuer des analyses reproductibles avec Nextflow. Le workflow commence par le traitement des lectures RNAseq brutes en utilisant Rcorrector pour la correction. Ensuite, les lectures non corrigées sont supprimées à l'aide d'un script Python. La contamination rRNA est également supprimée en utilisant Bowtie2 et la base de données SILVA avant un processus de filtrage de la qualité des lectures en utilisant Trim Galore. Enfin, l'assemblage du transcriptome est effectué en utilisant Trinity.

Ce projet est un webservice permettant la sélection et le filtrage de données pour des études statistiques ou des recherches spécifiques, ainsi que leur visualisation agrégée. Il s'exécute sous forme de container et dépend de plusieurs projets Git enregistrés en submodules.