Ce projet fournit un exemple de workflow structuré selon les conventions de Snakemake, un outil dédié à l'automatisation de pipelines bioinformatiques. Il illustre comment organiser des règles de traitement, des environnements logiciels et des scripts pour créer des workflows reproductibles et modulaires. Idéal pour les chercheurs ou développeurs souhaitant standardiser leurs analyses.

Ce projet fournit un workflow automatisé pour préparer des génomes avant l'analyse de données de séquençage haut débit. Il standardise les données génomiques en générant des fichiers de configuration adaptés aux pipelines d'analyse bioinformatique. Le workflow permet d'intégrer des références génomiques spécifiques et de produire des structures de données compatibles avec les outils d'analyse en aval. Il est conçu pour être utilisé dans des environnements de recherche biomédicale, notamment dans des laboratoires spécialisés en génomique.