Le projet only_obitools est une reproduction de la pipeline bioinformatique utilisée par SPYGEN pour générer des données sur la présence environnementale des espèces à partir de données brutes d'eDNA. Cette pipeline est basée sur OBItools, un ensemble d'outils python conçus pour analyser les sorties de séquenceurs de nouvelle génération (illumina) dans le contexte de la métabarcoding d'ADN.

Ce projet est un pipeline d'analyse de données environnementales permettant de générer des données sur la présence d'espèces dans l'environnement à partir de données d'ADN environnemental (eDNA). Il est basé sur le programme swarm, une méthode robuste et rapide de regroupement pour les études basées sur des amplicons.