Projet académique dédié à la réalisation de calculs scientifiques avancés et à l'analyse de données issues de simulations ou d'expériences. Il permet aux chercheurs et étudiants de traiter des modèles complexes, d'interpréter des résultats numériques et de générer des visualisations pertinentes pour des publications ou des rapports techniques.

Ce projet développe des outils de modélisation et de simulation pour étudier la dynamique des infections par le virus du papillome humain (HPV). Il permet d'analyser l'impact des événements aléatoires sur la persistance des infections, d'évaluer des stratégies d'allocation initiale de copies virales et de comparer des estimations théoriques avec des simulations. Les résultats sont utilisés pour générer des figures et des données destinées à des publications scientifiques.

Projet de recherche en biologie évolutive dédié à l'analyse des protéines SIR2 et SIRim. Il permet d'étudier leur histoire évolutive, leur phylogénie, leur détection dans les génomes, et leur implication dans les systèmes de défense. Des modèles structuraux (AlphaFold2) sont également générés pour certaines protéines eucaryotes. Les résultats sont présentés sous forme de figures et d'alignements pour des publications scientifiques.

Athena est un service dédié à la production automatisée d'indicateurs bibliométriques pour le domaine de la recherche publique. Il calcule des métriques comme le poids, l'influence et le prestige des publications scientifiques à partir de données OpenAlex. Le système génère des rapports détaillés sur les copublications, les revues de tête par discipline, les bourses ERC et les prix académiques. Les résultats sont utilisés pour alimenter l'onglet « bibliométrie » d'une application de tableaux de bord institutionnels, facilitant ainsi l'analyse et la visualisation des performances de la recherche.

Ce projet accompagne une publication scientifique visant à développer un cadre de travail pour résoudre des problèmes inverses en biologie. Il utilise des données de capteurs de phéromones pour détecter la présence d'insectes ravageurs dans les cultures. Le code permet de simuler la propagation des phéromones, d'optimiser la localisation des sources d'émission et de générer des cartes de présence d'insectes. Les résultats sont présentés sous forme de figures et de données exploitables pour la recherche agronomique.

Ce projet permet de traiter des données brutes et de générer des figures destinées à des publications scientifiques. Il inclut des outils pour analyser des données et produire des résultats visuels exploitables dans un contexte de recherche. Les algorithmes implémentés visent à faciliter l'interprétation des données pour des travaux académiques.

Outil dédié à l'analyse d'images confocal de plantes pour déterminer les limites en z des images 3D. Il permet de segmenter les structures biologiques, calculer les volumes cellulaires et générer des illustrations pour des publications scientifiques. Les scripts automatisent les étapes clés et produisent des résultats exploitables pour la recherche en biologie végétale.

Ce projet fournit des scripts dédiés à la création de visualisations graphiques à partir de données issues de séquençages haut débit. Utilisé principalement dans un contexte de recherche biomédicale, il permet aux scientifiques de générer des graphiques adaptés à leurs publications ou rapports, facilitant ainsi l'interprétation et la communication des résultats obtenus en laboratoire.

Dépôt de code source contenant les scripts et données nécessaires à l'analyse de données pour la recherche en génomique des plantes, avec pour objectif la publication d'un article scientifique. Les scripts permettent de générer des figures, tableaux et autres éléments de l'article. Les données et résultats sont organisés de manière claire pour faciliter la collaboration en recherche.

Ce projet génère un catalogue d'événements radio jovien à partir de données scientifiques brutes. Il transforme des fichiers de données typées en fichiers structurés pour compléter une publication académique. Le résultat est utilisé pour alimenter des bases de données et des pages web dédiées à la recherche en astrophysique.